The Journal of Molecular Modeling focuses on "hardcore" modeling, publishing high-quality research and reports. Founded in 1995 as a purely electronic journal, it has adapted its format to include a full-color print edition, and adjusted its aims and scope fit the fast-changing field of molecular modeling, with a particular focus on three-dimensional modeling.
Today, the journal covers all aspects of molecular modeling including life science modeling; materials modeling; new methods; and computational chemistry.
Topics include computer-aided molecular design; rational drug design, de novo ligand design, receptor modeling and docking; cheminformatics, data analysis, visualization and mining; computational medicinal chemistry; homology modeling; simulation of peptides, DNA and other biopolymers; quantitative structure-activity relationships (QSAR) and ADME-modeling; modeling of biological reaction mechanisms; and combined experimental and computational studies in which calculations play a major role.
《Journal Of Molecular Modeling》是一本由Springer Berlin Heidelberg出版商出版的專業化學期刊，該刊創刊于1995年，刊期Irregular，該刊已被國際權威數據庫SCIE收錄。在中科院最新升級版分區表中，該刊分區信息為大類學科：化學4區，小類學科：生化與分子生物學 4區；生物物理 4區；化學：綜合 4區；計算機：跨學科應用 4區；在JCR（Journal Citation Reports）分區等級為Q3。該刊發文范圍涵蓋BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY等領域，旨在及時、準確、全面地報道國內外BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY工作者在該領域取得的最新研究成果、工作進展及學術動態、技術革新等，促進學術交流，鼓勵學術創新。2023年影響因子為2.1，平均審稿速度 約2.3個月 。
中科院分區（當前數據版本：2023年12月升級版）
| 大類學科 | 分區 | 小類學科 | 分區 | Top期刊 | 綜述期刊 |
| 化學 | 4區 | BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY 生化與分子生物學 BIOPHYSICS 生物物理 CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY 化學：綜合 COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS 計算機：跨學科應用 | 4區 4區 4區 4區 | 否 | 否 |
中科院分區（當前數據版本：2022年12月升級版）
| 大類學科 | 分區 | 小類學科 | 分區 | Top期刊 | 綜述期刊 |
| 化學 | 4區 | BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY 生化與分子生物學 BIOPHYSICS 生物物理 CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY 化學：綜合 COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS 計算機：跨學科應用 | 4區 4區 4區 4區 | 否 | 否 |
中科院分區（當前數據版本：2021年12月舊的升級版）
| 大類學科 | 分區 | 小類學科 | 分區 | Top期刊 | 綜述期刊 |
| 化學 | 4區 | BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY 生化與分子生物學 BIOPHYSICS 生物物理 CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY 化學綜合 COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS 計算機：跨學科應用 | 4區 4區 4區 4區 | 否 | 否 |
中科院分區（當前數據版本：2021年12月基礎版）
| 大類學科 | 分區 | 小類學科 | 分區 | Top期刊 | 綜述期刊 |
| 化學 | 4區 | BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY 生化與分子生物學 BIOPHYSICS 生物物理 CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY 化學綜合 COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS 計算機：跨學科應用 | 4區 4區 4區 4區 | 否 | 否 |
中科院分區（當前數據版本：2021年12月升級版）
| 大類學科 | 分區 | 小類學科 | 分區 | Top期刊 | 綜述期刊 |
| 化學 | 4區 | BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY 生化與分子生物學 BIOPHYSICS 生物物理 CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY 化學綜合 COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS 計算機：跨學科應用 | 4區 4區 4區 4區 | 否 | 否 |
中科院分區（當前數據版本：2020年12月舊的升級版）
| 大類學科 | 分區 | 小類學科 | 分區 | Top期刊 | 綜述期刊 |
| 化學 | 4區 | BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY 生化與分子生物學 BIOPHYSICS 生物物理 CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY 化學綜合 COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS 計算機：跨學科應用 | 4區 4區 4區 4區 | 否 | 否 |
名詞釋義：中科院分區是中國科學院國家科學圖書館制定，中科院分區目前分為基礎版和升級版（試行），基礎版先將JCR中所有期刊分為13大類學科，每個學科分類按照期刊的3年平均影響因子高低，分為4四個區；升級版將期刊分為18個大類學科，涵蓋數學、物理與天體物理、化學、材料科學、地球科學等大類學科；升級版設計了“期刊超越指數”取代影響因子指標。期刊超越指數即本刊論文的被引頻次高于相同主題、相同文獻類型的其它期刊的概率。
JCR分區（當前數據版本：2023-2024年最新版）
| 按JIF指標學科分區 | 收錄子集 | 分區 | 排名 | 百分位 |
| 學科：BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY | SCIE | Q4 | 243 / 313 |
22.5% |
| 學科：BIOPHYSICS | SCIE | Q3 | 52 / 77 |
33.1% |
| 學科：CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY | SCIE | Q3 | 129 / 230 |
44.1% |
| 學科：COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS | SCIE | Q3 | 101 / 169 |
40.5% |
| 按JCI指標學科分區 | 收錄子集 | 分區 | 排名 | 百分位 |
| 學科：BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY | SCIE | Q4 | 246 / 313 |
21.57% |
| 學科：BIOPHYSICS | SCIE | Q3 | 55 / 77 |
29.22% |
| 學科：CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY | SCIE | Q2 | 115 / 231 |
50.43% |
| 學科：COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS | SCIE | Q3 | 116 / 169 |
31.66% |
名詞釋義：JCR（Journal Citation Reports）由科睿唯安公司（前身為湯森路透）開發，JCR分區將期刊分為176個學科。該排名根據當年不同學科的影響因子，分為Q1、Q2、Q3、Q4四個區域。 Q1代表不同學科進行分類可以影響細胞因子前25％的期刊，以此作為類推，Q2是前25％-50％的期刊，Q3是前50％-75％的期刊，Q4是后期75％的期刊。
Cite Score 排名
| CiteScore | SJR | SNIP | 學科類別 | 分區 | 排名 | 百分位 |
| 3.5 | 0.332 | 0.543 | 大類：Computer Science 小類：Computational Theory and Mathematics | Q2 | 75 / 176 |
57% |
| 大類：Computer Science 小類：Computer Science Applications | Q3 | 436 / 817 |
46% |
|||
| 大類：Computer Science 小類：Inorganic Chemistry | Q3 | 43 / 79 |
46% |
|||
| 大類：Computer Science 小類：Physical and Theoretical Chemistry | Q3 | 112 / 189 |
41% |
|||
| 大類：Computer Science 小類：Organic Chemistry | Q3 | 128 / 211 |
39% |
|||
| 大類：Computer Science 小類：Catalysis | Q3 | 49 / 68 |
28% |
名詞釋義：CiteScore 是在 Scopus 中衡量期刊影響力的另一個指標，其作用是測量期刊的篇均影響力。當年CiteScore 的計算依據是期刊最近4年 （含計算年度） 的被引次數除以該期刊近四年發表的文獻數，文獻類型包括：文章、評論、會議論文、書籍章節和數據論文，社論勘誤表、信件、說明和簡短調查等非同行評議的文獻類型均不包含在內。
1、Journal Of Molecular Modeling期刊級別中等偏靠后，影響力一般，競爭相對來說不算太難，過審也相對較容易，建議您可以關注。研究方向為化學 - 化學綜合，建議您投遞與此行業相關的稿件，以兔被拒稿耽誤您的時間。建議稿件控制10頁以上，4600單詞字數以上（未翻譯中文字數8600字數以上）；文章撰寫語言為英語；（單欄格式，單倍行距，內容10號字體，文章內容包含：題目，所有作者姓名、最高學位，作者單位（精確到部門），通信作者郵箱，摘要，關鍵詞，內容，總結，項目基金，參考文獻，所有作者相片+簡介）。
2、該期刊近年沒有被列入國際期刊預警名單（2021年12月發布的2021版），廣大學者可以放心選擇。鼓勵提交以前未發表的文章，禁止一稿多投；拒絕抄襲、機械性的稿件；平均審稿速度 約2.3個月 。
3、稿件重復率控制10%以內，論文務必保證原創性、圖標、公式、引文等要素齊備，已發表或引用過度的文章將不會被出版和檢索。
4、稿件必須有較好的英語表達水平，有圖，有表，有公式，有數據或設計，有算法（方案，模型），實驗，仿真等。
5、參考文獻控制25條以上，參考文獻引用一半以上控制在近5年以內；圖表分辨率必須達到300dpi；參考文獻與文獻綜述能反映國際研究前沿。
6、若您想聯系Journal Of Molecular Modeling出版商，請根據該地址聯系：SPRINGER, 233 SPRING ST, NEW YORK, USA, NY, 10013。
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| 影響因子 | h-index | Gold OA文章占比 | 研究類文章占比 | OA開放訪問 | 平均審稿速度 |
| 2.1 | 61 | 3.88% | 99.74% | 未開放 | 約2.3個月 |
IF值(影響因子)趨勢圖
中科院JCR分區趨勢圖
引文指標和發文量趨勢圖
自引數據趨勢圖
名詞釋義：影響因子 簡稱IF，是湯森路透（Thomson Reuters）出品的期刊引證報告（Journal Citation Reports，JCR）中的一項數據。 即某期刊前兩年發表的論文在該報告年份（JCR year）中被引用總次數除以該期刊在這兩年內發表的論文總數。這是一個國際上通行的期刊評價指標，是衡量學術期刊影響力的一個重要指標。
| 中科院同小類學科熱門期刊 | 影響因子 | 中科院分區 | 瀏覽次數 |
| Journal Of Colloid And Interface Science | 9.4 | 1區 | 4102 |
| Chem | 19.1 | 1區 | 2925 |
| Molecules | 4.2 | 2區 | 2418 |
| Journal Of Solution Chemistry | 1.4 | 4區 | 2216 |
| International Journal Of Biological Macromolecules | 7.7 | 1區 | 2191 |
| Microchemical Journal | 4.9 | 2區 | 2016 |
| Journal Of Molecular Structure | 4 | 2區 | 1978 |
| Acs Omega | 3.7 | 3區 | 1830 |
| Journal Of Rubber Research | 1.2 | 4區 | 1728 |
| Sensors And Actuators B-chemical | 8 | 1區 | 1609 |
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